市内を流下する河川は、一級河川が2水系、18河川、二級河川が3水系、4河川、準用河川が5水系34河川です。
一級河川（国が管理を行っている河川）
一級河川（国が管理を行っている河川）の一覧
| 水系名 |
河川名 |
延長 |
| 大井川水系 |
大井川 |
40,600メートル |
一級河川（静岡県が管理を行っている河川）
一級河川（静岡県が管理を行っている河川）の一覧
| 水系名 |
河川名 |
延長 |
| 大井川水系 |
大井川 |
127,690メートル |
| 大井川水系 |
大津谷川 |
3,850メートル |
| 大井川水系 |
伊太谷川 |
5,700メートル |
| 大井川水系 |
尾川 |
1,400メートル |
| 大井川水系 |
大代川 |
11,740メートル |
| 大井川水系 |
新堀川 |
910メートル |
| 大井川水系 |
清水川 |
400メートル |
| 大井川水系 |
童子沢川 |
1,390メートル |
| 大井川水系 |
相賀谷川 |
5,000メートル |
| 大井川水系 |
伊久美川 |
13,760メートル |
| 大井川水系 |
大久保川 |
4,500メートル |
| 大井川水系 |
福用川 |
1,180メートル |
| 大井川水系 |
白光川 |
1,380メートル |
| 大井川水系 |
身成川 |
3,700メートル |
| 大井川水系 |
家山川 |
5,640メートル |
| 大井川水系 |
切山川 |
1,650メートル |
| 大井川水系 |
笹間川 |
15,500メートル |
| 菊川水系 |
菊川 |
27,670メートル |
二級河川（静岡県が管理を行っている河川）
二級河川（静岡県が管理を行っている河川）の一覧
| 水系名 |
河川名 |
延長 |
| 栃山川水系 |
栃山川 |
13,600メートル |
| 栃山川水系 |
東光寺谷川 |
6,150メートル |
| 湯日川水系 |
湯日川 |
15,860メートル |
| 勝間田川水系 |
勝間田川 |
14,550メートル |
準用河川（島田市が管理を行っている河川）
準用河川一覧
| 水系名 |
河川名 |
延長 |
| 大井川水系 |
丹原川 |
1,200メートル |
| 大井川水系 |
神座中央水路 |
2,800メートル |
| 大井川水系 |
大沢谷川 |
2,200メートル |
| 大井川水系 |
大津谷川 |
3,200メートル |
| 大井川水系 |
大蟹沢 |
1,000メートル |
| 大井川水系 |
波田川 |
1,300メートル |
| 大井川水系 |
鵜田沢 |
1,500メートル |
| 大井川水系 |
伊太谷川 |
1,200メートル |
| 大井川水系 |
龍泉院川 |
1,600メートル |
| 大井川水系 |
静居寺沢 |
2,000メートル |
| 大井川水系 |
尾川 |
2,100メートル |
| 大井川水系 |
西沢 |
2,000メートル |
| 大井川水系 |
相賀谷川 |
2,100メートル |
| 大井川水系 |
大森沢 |
2,000メートル |
| 大井川水系 |
ドンボリ川 |
940メートル |
| 大井川水系 |
木屋川 |
380メートル |
| 大井川水系 |
宿川 |
450メートル |
| 大井川水系 |
早川 |
2,100メートル |
| 大井川水系 |
沢川 |
1,300メートル |
| 大井川水系 |
孫九郎川 |
1,200メートル |
| 大井川水系 |
沢根川 |
2,100メートル |
| 大井川水系 |
湯沢川 |
433メートル |
| 大井川水系 |
笹間川 |
15,240メートル |
| 大井川水系 |
本沢 |
4,300メートル |
| 大井川水系 |
後藤沢川 |
746メートル |
| 大井川水系 |
上手川 |
3,000メートル |
| 大井川水系 |
堀川 |
449メートル |
| 大井川水系 |
大田ヶ谷沢川 |
963メートル |
| 栃山川水系 |
東光寺谷川 |
1,900メートル |
| 湯日川水系 |
湯日谷川 |
1,041メートル |
| 湯日川水系 |
長池川 |
1,200メートル |
| 湯日川水系 |
沢川 |
2,500メートル |
| 菊川水系 |
小鮒川 |
700メートル |
| 勝間田川水系 |
勝間田川 |
750メートル |
